Przy pomocy PEFS gromadzenie są informacji na temat Beneficjentów Ostatecznych celem monitorowania efektów zrealizowanego wsparcia, po zakończeniu wdrażania poszczególnych projektów.
Informacje gromadzone w PEFS służą do wyliczania wskaźników realizacji na poziomie projektów, Działań, Priorytetów oraz całego Programu Operacyjnego.